{"id":340448,"date":"2017-01-02T01:00:00","date_gmt":"2017-01-02T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/medizinonline.com\/diarrhee-infectieuse-aigue-diagnostic-2-0\/"},"modified":"2017-01-02T01:00:00","modified_gmt":"2017-01-02T00:00:00","slug":"diarrhee-infectieuse-aigue-diagnostic-2-0","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/diarrhee-infectieuse-aigue-diagnostic-2-0\/","title":{"rendered":"Diarrh\u00e9e infectieuse aigu\u00eb : diagnostic 2.0"},"content":{"rendered":"<p><strong>La diarrh\u00e9e est d\u00e9finie par l&#8217;\u00e9mission d&#8217;au moins trois selles non form\u00e9es en l&#8217;espace de 24 heures. Si les sympt\u00f4mes disparaissent dans les 14 jours, on parle de diarrh\u00e9e &#8220;aigu\u00eb&#8221; [1]. Les \u00e9tiologies de la diarrh\u00e9e sont multiples et comprennent, outre les infections, de nombreuses causes non infectieuses. Les signes d&#8217;un \u00e9v\u00e9nement infectieux peuvent \u00eatre, entre autres, un d\u00e9but aigu, de la fi\u00e8vre et une accumulation de cas dans le temps [1]. Les diarrh\u00e9es infectieuses aigu\u00ebs contract\u00e9es en ambulatoire sont fr\u00e9quentes, g\u00e9n\u00e9ralement autolimit\u00e9es et ne conduisent donc qu&#8217;exceptionnellement \u00e0 une consultation et dans les cas les plus graves.<\/strong><strong>  Le pr\u00e9sent article discute de l&#8217;\u00e9valuation microbiologique des patients symptomatiques pr\u00e9sentant une diarrh\u00e9e aigu\u00eb et une \u00e9tiologie infectieuse pr\u00e9sum\u00e9e. Les diarrh\u00e9es persistantes (&gt;14 jours) ou chroniques (&gt;quatre semaines) ne sont pas cibl\u00e9es.  <\/strong><\/p>\n<p> <!--more--> <\/p>\n<p>Quel que soit le m\u00e9canisme, la plupart des gastro-ent\u00e9rites bact\u00e9riennes sont autolimit\u00e9es et, \u00e0 quelques exceptions pr\u00e8s, ne n\u00e9cessitent ni traitement antibiotique empirique ni culture de selles : jusqu&#8217;\u00e0 l&#8217;obtention de leurs r\u00e9sultats, les sympt\u00f4mes de la plupart des patients ont disparu, ce qui signifie que les cultures de selles ne contribuent g\u00e9n\u00e9ralement pas aux soins des patients [2]. Selon les directives de la Soci\u00e9t\u00e9 am\u00e9ricaine de gastroent\u00e9rologie, les cas cliniquement graves avec diarrh\u00e9e s\u00e9v\u00e8re et persistante et d\u00e9shydratation, fi\u00e8vre sup\u00e9rieure \u00e0 38,5\u00b0C et pr\u00e9sence de sang dans les selles sont exclus [3]. Des consid\u00e9rations diagnostiques particuli\u00e8res sont \u00e9galement indiqu\u00e9es chez les voyageurs de retour de voyage, chez les patients immunocompromis ainsi qu&#8217;en cas de diarrh\u00e9e associ\u00e9e \u00e0 l&#8217;h\u00f4pital et en cas d&#8217;accumulation de cas de maladie dans le temps.<\/p>\n<h2 id=\"diagnostic-standard-par-biologie-moleculaire-bacteriologie-fecale-generale\">Diagnostic standard par biologie mol\u00e9culaire &#8211; Bact\u00e9riologie f\u00e9cale g\u00e9n\u00e9rale<\/h2>\n<p>Lors de l&#8217;examen microbiologique de la diarrh\u00e9e bact\u00e9rienne aigu\u00eb acquise en ambulatoire, les m\u00e9thodes de biologie mol\u00e9culaire pour la d\u00e9tection des pathog\u00e8nes intestinaux bact\u00e9riens les plus fr\u00e9quents<strong> (tableau&nbsp;1)<\/strong> sont beaucoup plus sensibles que la culture et ne sont gu\u00e8re influenc\u00e9es par des pr\u00e9analyses inappropri\u00e9es ou par l&#8217;administration d&#8217;antibiotiques. Les craintes que les techniques de biologie mol\u00e9culaire puissent d\u00e9tecter des acides nucl\u00e9iques sp\u00e9cifiques de l&#8217;agent pathog\u00e8ne mais biologiquement inactifs sont infond\u00e9es, du moins pour les infections <em>\u00e0 Campylobacter <\/em>, comme nous avons pu le montrer r\u00e9cemment : La r\u00e9ponse inflammatoire intestinale et la charge pathog\u00e8ne sont directement corr\u00e9l\u00e9es dans les <em>infections \u00e0 Campylobacter<\/em>[4]. L&#8217;exp\u00e9rience acquise jusqu&#8217;\u00e0 pr\u00e9sent montre que la disponibilit\u00e9 rapide des r\u00e9sultats des examens est particuli\u00e8rement importante pour les premiers soins aux patients. Les cultures ne sont cibl\u00e9es que secondairement, en pr\u00e9sence d&#8217;une d\u00e9tection positive de l&#8217;agent pathog\u00e8ne par biologie mol\u00e9culaire (&#8220;test r\u00e9flexe&#8221;), afin de disposer ainsi de l&#8217;isolat du patient pour effectuer des tests de r\u00e9sistance et des examens compl\u00e9mentaires importants sur le plan \u00e9pid\u00e9miologique (par ex. s\u00e9rotypage).<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><img fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" class=\" size-full wp-image-8184\" alt=\"\" src=\"https:\/\/medizinonline.com\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/tab1_hp12_s40_0.png\" style=\"height:371px; width:400px\" width=\"884\" height=\"821\" srcset=\"https:\/\/medizinonline.com\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/tab1_hp12_s40_0.png 884w, https:\/\/medizinonline.com\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/tab1_hp12_s40_0-800x743.png 800w, https:\/\/medizinonline.com\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/tab1_hp12_s40_0-120x111.png 120w, https:\/\/medizinonline.com\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/tab1_hp12_s40_0-90x84.png 90w, https:\/\/medizinonline.com\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/tab1_hp12_s40_0-320x297.png 320w, https:\/\/medizinonline.com\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/tab1_hp12_s40_0-560x520.png 560w\" sizes=\"(max-width: 884px) 100vw, 884px\" \/><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>Les agents zoonotiques <em>Campylobacter, <\/em>Salmonella non typho\u00efde et EHEC font partie, avec les Shigella, des quatre pathog\u00e8nes intestinaux bact\u00e9riens les plus fr\u00e9quemment signal\u00e9s aux \u00c9tats-Unis [5]. Le diagnostic standard par biologie mol\u00e9culaire <strong>(tableau&nbsp;1) <\/strong>permet donc de d\u00e9tecter les pathog\u00e8nes intestinaux bact\u00e9riens les plus fr\u00e9quents. Par exemple, la Suisse enregistre chaque ann\u00e9e plus de 7000 <em>infections \u00e0 Campylobacter<\/em>confirm\u00e9es en laboratoire, avec des pics en \u00e9t\u00e9 pendant la saison des barbecues et pendant les f\u00eates de fin d&#8217;ann\u00e9e [6]. C&#8217;est pourquoi, dans un contexte clinique et \u00e9pid\u00e9miologique donn\u00e9 &#8211; par exemple en cas de suspicion clinique d&#8217;une infection \u00e0 <em>Campylobacter<\/em> pendant les f\u00eates de fin d&#8217;ann\u00e9e &#8211; la demande d&#8217;un diagnostic standard pour clarifier une diarrh\u00e9e aigu\u00eb peut \u00eatre suffisante et cibl\u00e9e. Gr\u00e2ce \u00e0 l&#8217;utilisation de m\u00e9thodes ind\u00e9pendantes de la culture, les r\u00e9sultats des analyses sont g\u00e9n\u00e9ralement disponibles le jour m\u00eame. L&#8217;envoi de plusieurs \u00e9chantillons de patients par \u00e9pisode n&#8217;est plus n\u00e9cessaire, ce qui est d\u00fb d&#8217;une part \u00e0 la disponibilit\u00e9 en temps r\u00e9el des r\u00e9sultats d&#8217;analyse et d&#8217;autre part \u00e0 la grande sensibilit\u00e9 des m\u00e9thodes de biologie mol\u00e9culaire. Nous pensons que le fait de ne pas envoyer plus d&#8217;un \u00e9chantillon par patient et par \u00e9pisode pourrait permettre de r\u00e9aliser des \u00e9conomies.<\/p>\n<p>Tous les \u00e9chantillons de selles test\u00e9s positifs sont mis en culture de mani\u00e8re cibl\u00e9e afin de disposer de l&#8217;isolat du patient correspondant pour un test de r\u00e9sistance et d&#8217;autres examens compl\u00e9mentaires importants sur le plan \u00e9pid\u00e9miologique, comme le s\u00e9rotypage des salmonelles (test r\u00e9flexe). Ces r\u00e9sultats ne sont g\u00e9n\u00e9ralement disponibles que plusieurs jours plus tard, car les m\u00e9thodes bas\u00e9es sur la culture prennent beaucoup de temps. Il n&#8217;est pas rare que des isolats de patients soient \u00e9galement envoy\u00e9s au Centre national des bact\u00e9ries ent\u00e9ropathog\u00e8nes et des listeria (NENT) pour une caract\u00e9risation ou une confirmation plus pouss\u00e9e [7].<\/p>\n<p>Au cours du traitement par culture d&#8217;\u00e9chantillons de selles positifs par biologie mol\u00e9culaire, nous observons parfois que les milieux de culture mis en place restent n\u00e9gatifs et que l&#8217;agent pathog\u00e8ne indiqu\u00e9 ne peut pas \u00eatre cultiv\u00e9. Ce ph\u00e9nom\u00e8ne est particuli\u00e8rement fr\u00e9quent lors de la culture de <em>Campylobacter<\/em> et de Shigella. Dans ce contexte, c&#8217;est l&#8217;occasion de souligner l&#8217;importance de la pr\u00e9-analyse et du transport des \u00e9chantillons pour la d\u00e9tection des agents pathog\u00e8nes par culture. Les \u00e9chantillons de selles fra\u00eeches doivent \u00eatre trait\u00e9s dans les deux heures suivant leur pr\u00e9l\u00e8vement au laboratoire ; ce d\u00e9lai est particuli\u00e8rement critique pour la survie de <em>Campylobacter<\/em> et de Shigella. Si un \u00e9chantillon de selles frais ne peut pas \u00eatre trait\u00e9 au laboratoire dans les deux heures suivant son pr\u00e9l\u00e8vement, il doit \u00eatre plac\u00e9 dans un tube contenant le milieu de transport Cary-Blair et envoy\u00e9 au laboratoire [2].<\/p>\n<h2 id=\"diagnostic-oriente-vers-le-syndrome\">Diagnostic orient\u00e9 vers le syndrome<\/h2>\n<p>Le diagnostic ax\u00e9 sur les syndromes implique l&#8217;utilisation de techniques de biologie mol\u00e9culaire qui permettent d&#8217;analyser simultan\u00e9ment des \u00e9chantillons de patients pour d\u00e9tecter la pr\u00e9sence de plus de 20 agents bact\u00e9riens, parasitaires et viraux, en fonction de la pr\u00e9sentation clinique ou du syndrome pr\u00e9sent. La composition des batteries d&#8217;agents pathog\u00e8nes est bas\u00e9e sur des donn\u00e9es globales concernant l&#8217;\u00e9pid\u00e9miologie de chaque agent pathog\u00e8ne <strong>(tableau&nbsp;2).<\/strong><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><img decoding=\"async\" class=\"size-full wp-image-8185 lazyload\" alt=\"\" data-src=\"https:\/\/medizinonline.com\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/tab2_hp12_s42.png\" style=\"--smush-placeholder-width: 1100px; --smush-placeholder-aspect-ratio: 1100\/1117;height:812px; width:800px\" width=\"1100\" height=\"1117\" src=\"data:image\/svg+xml;base64,PHN2ZyB3aWR0aD0iMSIgaGVpZ2h0PSIxIiB4bWxucz0iaHR0cDovL3d3dy53My5vcmcvMjAwMC9zdmciPjwvc3ZnPg==\"><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>Contrairement \u00e0 la proc\u00e9dure standard, les agents pathog\u00e8nes qui ne correspondent pas \u00e0 l&#8217;\u00e9pid\u00e9miologie locale sont \u00e9galement d\u00e9tect\u00e9s. Cela rend l&#8217;utilisation de batteries d&#8217;agents pathog\u00e8nes particuli\u00e8rement pr\u00e9cieuse dans l&#8217;\u00e9valuation des patients de retour de voyage et des patients immunocompromis chez qui on soup\u00e7onne une diarrh\u00e9e infectieuse aigu\u00eb. Un examen orient\u00e9 sur les syndromes peut \u00e9galement \u00eatre utile dans le contexte de cas de maladie associ\u00e9s \u00e0 l&#8217;h\u00f4pital ou en cas d&#8217;accumulation dans le temps de cas de maladie d&#8217;\u00e9tiologie incertaine<strong> (fig.&nbsp;1).<\/strong><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><img decoding=\"async\" class=\"size-full wp-image-8186 lazyload\" alt=\"\" data-src=\"https:\/\/medizinonline.com\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/abb1_hp12_s44.png\" style=\"--smush-placeholder-width: 1100px; --smush-placeholder-aspect-ratio: 1100\/982;height:714px; width:800px\" width=\"1100\" height=\"982\" src=\"data:image\/svg+xml;base64,PHN2ZyB3aWR0aD0iMSIgaGVpZ2h0PSIxIiB4bWxucz0iaHR0cDovL3d3dy53My5vcmcvMjAwMC9zdmciPjwvc3ZnPg==\"><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2 id=\"infections-multiples\">Infections multiples<\/h2>\n<p>L&#8217;utilisation de larges batteries d&#8217;agents pathog\u00e8nes lors de l&#8217;examen microbiologique initial de la diarrh\u00e9e aigu\u00eb rend de plus en plus \u00e9vident le fait que les infections multiples sont probablement plus fr\u00e9quentes chez nous qu&#8217;on ne le pensait jusqu&#8217;\u00e0 pr\u00e9sent [8]. D&#8217;apr\u00e8s notre exp\u00e9rience, les infections multiples avec deux agents pathog\u00e8nes intestinaux potentiels ou plus sont particuli\u00e8rement fr\u00e9quentes chez les voyageurs de retour de voyage. Cela correspond aux r\u00e9sultats de l&#8217;\u00e9tude Global Enteric Multicenter Study (GEMS), qui a suivi de mani\u00e8re prospective plus de 9 000 enfants \u00e2g\u00e9s de moins de cinq ans souffrant de diarrh\u00e9e mod\u00e9r\u00e9e \u00e0 s\u00e9v\u00e8re dans sept pays d&#8217;Afrique et d&#8217;Asie du Sud-Est sur une p\u00e9riode de 36 mois [9]. Au total, plus d&#8217;un pathog\u00e8ne intestinal a \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9 chez 45% de ces enfants. Il convient de noter que m\u00eame chez les t\u00e9moins sains, plus de deux pathog\u00e8nes intestinaux potentiels ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9s dans 31% des cas.<\/p>\n<h2 id=\"diagnostic-2-0\">Diagnostic 2.0<\/h2>\n<p>La combinaison de la g\u00e9n\u00e9tique mol\u00e9culaire et de la culture (Diagnostic 2.0) combine les avantages d&#8217;une d\u00e9tection rapide, sensible et sp\u00e9cifique des agents pathog\u00e8nes pour les soins imm\u00e9diats aux patients avec la possibilit\u00e9 d&#8217;isoler et de caract\u00e9riser plus en profondeur les agents pathog\u00e8nes par culture. Les gastro-ent\u00e9rites infectieuses aigu\u00ebs sont fr\u00e9quentes, g\u00e9n\u00e9ralement autolimit\u00e9es et ne conduisent qu&#8217;exceptionnellement \u00e0 une consultation. Dans les cas graves, un examen microbiologique peut \u00eatre indiqu\u00e9 [3]. Aujourd&#8217;hui, gr\u00e2ce aux progr\u00e8s technologiques, nous disposons de plusieurs options de diagnostic. Les premi\u00e8res indications sont fournies par l&#8217;anamn\u00e8se et la pr\u00e9sentation clinique du patient <strong>(Fig.&nbsp;1). <\/strong>Toutes les options de diagnostic ont en commun la disponibilit\u00e9 rapide des r\u00e9sultats d&#8217;examen, en g\u00e9n\u00e9ral le jour m\u00eame si l&#8217;\u00e9chantillon du patient est re\u00e7u avant 11&nbsp;. Les r\u00e9sultats d&#8217;examen sont ensuite transmis au laboratoire d&#8217;analyses.<\/p>\n<h2 id=\"diagnostic-standard\">Diagnostic standard<\/h2>\n<p>Le diagnostic standard est suffisant pour d\u00e9tecter les pathog\u00e8nes intestinaux bact\u00e9riens les plus fr\u00e9quemment associ\u00e9s \u00e0 la diarrh\u00e9e aigu\u00eb. La culture cibl\u00e9e d&#8217;\u00e9chantillons de patients positifs fait partie de l&#8217;enqu\u00eate et ne doit pas \u00eatre demand\u00e9e sp\u00e9cifiquement (test r\u00e9flexe). L&#8217;utilisation du kit d&#8217;infection intestinale pour le transport des \u00e9chantillons am\u00e9liore les taux de d\u00e9tection des cultures, en particulier pour <em>Campylobacter <\/em>et Shigella. Les isolats de patients sont disponibles pour des \u00e9tudes suppl\u00e9mentaires, telles que les tests de r\u00e9sistance.<\/p>\n<p>Selon le contexte clinique, il n&#8217;est pas rare que le diagnostic standard soit \u00e9tendu \u00e0 la d\u00e9tection s\u00e9lective de norovirus et\/ou de Clostridium difficile produisant des toxines. Ces deux analyses fournissent \u00e9galement des r\u00e9sultats le m\u00eame jour.<\/p>\n<h2 id=\"utilisation-de-larges-batteries-dexcitateurs\">Utilisation de larges batteries d&#8217;excitateurs<\/h2>\n<p>Le diagnostic ax\u00e9 sur le syndrome peut \u00eatre sup\u00e9rieur au diagnostic standard dans des cas s\u00e9lectionn\u00e9s. Nous pensons qu&#8217;il s&#8217;agit notamment des patients de retour de voyage et des patients immunocompromis, ainsi que de certains cas de diarrh\u00e9e associ\u00e9e \u00e0 l&#8217;hospitalisation et d&#8217;une accumulation de cas de maladie dans le temps qui n&#8217;est pas claire. L\u00e0 encore, la culture cibl\u00e9e d&#8217;\u00e9chantillons de patients test\u00e9s positifs fait partie int\u00e9grante de l&#8217;enqu\u00eate (test r\u00e9flexe), dans la mesure du possible ; le kit dit d&#8217;infection intestinale est recommand\u00e9 pour le transport des \u00e9chantillons.<\/p>\n<h2 id=\"voyageur-de-retour\">Voyageur de retour<\/h2>\n<p>Les<em> Escherichia coli <\/em> ent\u00e9rotoxinog\u00e8nes (ETEC) sont responsables de la diarrh\u00e9e des voyageurs dans pr\u00e8s de 50% des cas, ce qui en fait la principale cause de diarrh\u00e9e des voyageurs [1]. Les <em>E. c<\/em> oli ent\u00e9ro-aggr\u00e9gatifs (EAEC) et les <em>E. coli <\/em> ent\u00e9ro-invasifs (EIEC) jouent \u00e9galement un r\u00f4le important dans ce domaine et, tout comme les ETEC, ne sont pas d\u00e9tect\u00e9s par les diagnostics standard. Les infections multiples sont relativement fr\u00e9quentes.<\/p>\n<h2 id=\"patients-immunocompromis\">Patients immunocompromis<\/h2>\n<p>Les troubles gastro-intestinaux sont relativement fr\u00e9quents chez les patients immunocompromis et il n&#8217;est pas rare qu&#8217;ils \u00e9voluent vers la chronicit\u00e9. Dans ce contexte, il peut \u00eatre difficile de distinguer une diarrh\u00e9e infectieuse aigu\u00eb d&#8217;une aggravation transitoire dans le cadre de la pathologie sous-jacente, en particulier parce qu&#8217;en raison de l&#8217;immunod\u00e9ficience, des pathog\u00e8nes intestinaux potentiels plus rares peuvent \u00eatre mis en cause en plus des pathog\u00e8nes fr\u00e9quents. Dans ce cas, le diagnostic ax\u00e9 sur les syndromes offre des avantages ind\u00e9niables en couvrant un large \u00e9ventail de pathog\u00e8nes intestinaux bact\u00e9riens, parasitaires et viraux et d\u00e9tecte \u00e9galement les infections multiples.<\/p>\n<h2 id=\"diarrhee-associee-a-lhospitalisation\">Diarrh\u00e9e associ\u00e9e \u00e0 l&#8217;hospitalisation<\/h2>\n<p>Les troubles gastro-intestinaux et les diarrh\u00e9es sont relativement fr\u00e9quents \u00e0 l&#8217;h\u00f4pital et peuvent \u00eatre dus \u00e0 une perturbation de la flore intestinale due \u00e0 un traitement antibiotique. Il faut distinguer les diarrh\u00e9es caus\u00e9es par <em>Clostridium difficile<\/em> producteur de toxines, qui sont de plus en plus souvent contract\u00e9es en ambulatoire [5]. Dans les services d&#8217;urgence, le triage efficace des patients atteints de diarrh\u00e9e infectieuse rev\u00eat \u00e9galement une importance en termes d&#8217;hygi\u00e8ne hospitali\u00e8re : les pathog\u00e8nes \u00e0 faible dose infectieuse tels que Shigella et EHEC, mais aussi les protozoaires et les virus, se transmettent particuli\u00e8rement facilement \u00e0 d&#8217;autres personnes et comportent un risque d&#8217;\u00e9pid\u00e9mies hospitali\u00e8res [5]. L&#8217;identification en temps r\u00e9el de ces patients est donc dans l&#8217;int\u00e9r\u00eat du patient et de l&#8217;institution.<\/p>\n<h2 id=\"accumulation-temporelle-de-cas-de-maladie-detiologie-incertaine\">Accumulation temporelle de cas de maladie d&#8217;\u00e9tiologie incertaine<\/h2>\n<p>En cas d&#8217;accumulation dans le temps de cas de maladie avec une anamn\u00e8se peu concluante et une pr\u00e9sentation clinique peu caract\u00e9ristique, l&#8217;investigation orient\u00e9e sur le syndrome des premiers cas de maladie peut \u00eatre un moyen simple et finalement aussi rentable de clarifier rapidement une situation peu claire.<\/p>\n<h2 id=\"conclusion\">Conclusion<\/h2>\n<p><em>&#8220;J&#8217;envisage que dans un avenir proche, les m\u00e9thodes de laboratoire conventionnelles visant \u00e0 isoler des pathog\u00e8nes sp\u00e9cifiques deviendront des outils de seconde ligne \u00e0 d\u00e9ployer uniquement lorsque le d\u00e9pistage multiplex le juge n\u00e9cessaire&#8221;, <\/em>a \u00e9crit le professeur Franz Allerberger de l&#8217;Agence autrichienne pour la sant\u00e9 et la s\u00e9curit\u00e9 alimentaire (AGES) [10]. Les avantages de la d\u00e9tection de l&#8217;agent pathog\u00e8ne par biologie mol\u00e9culaire, ind\u00e9pendante de la culture, r\u00e9sident principalement dans la disponibilit\u00e9 rapide des r\u00e9sultats d&#8217;analyse et dans la relative insensibilit\u00e9 aux influences perturbatrices pendant le pr\u00e9l\u00e8vement et le transport des \u00e9chantillons. Les inconv\u00e9nients possibles sont que seuls les agents pathog\u00e8nes connus peuvent \u00eatre recherch\u00e9s et d\u00e9tect\u00e9s ; les agents pathog\u00e8nes \u00e9mergents ou les variantes d&#8217;agents pathog\u00e8nes connus peuvent ne pas \u00eatre d\u00e9tect\u00e9s, bien qu&#8217;ils soient cliniquement pertinents. La combinaison avec les m\u00e9thodes de d\u00e9tection par culture combine les avantages d&#8217;une d\u00e9tection rapide, sensible et sp\u00e9cifique des agents pathog\u00e8nes pour les soins imm\u00e9diats aux patients avec la possibilit\u00e9 d&#8217;isoler et de caract\u00e9riser plus en profondeur les agents pathog\u00e8nes par culture.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>\n<em>Reproduction avec l&#8217;aimable autorisation du Labormedizinisches Zentrum Dr. Risch AG, 3097 Bern-Liebefeld. D&#8217;abord publi\u00e9 dans Riport 81 (printemps 2016) : www.risch.ch\/de\/10123\/riport.html.<\/em><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>Litt\u00e9rature :<\/p>\n<ol>\n<li>Mandell, Douglas, and Bennett&#8217;s Principles and Practice of Infectious Diseases, <sup>8th<\/sup> ed. 2015.<\/li>\n<li>Humphries RM, et al : Diagnostic de laboratoire de la gastroent\u00e9rite bact\u00e9rienne. Clin Microbiol Rev 2015 ; 28 : 3.<\/li>\n<li>DuPont HL : Guidelines on acute infectious diarrhea in adults. The Practice Parameters Committee of the American College of Gastroenterology. Am J Gastroenterol 1997 ; 92 : 1962.<\/li>\n<li>Wohlwend N, et al : Evaluation of a multiplex real-time PCR assay for detecting major bacterial enteric pathogens in fecal specimens : intestinal inflammation and bacterial load are correlated in Campylobacter infections. J Clin Microbiol 2016 ; 54 : 2262-2266.<\/li>\n<li>DuPont HL : Diarrh\u00e9e bact\u00e9rienne. New Engl J Med 2009 ; 361 : 1560.<\/li>\n<li>www.blv.admin.ch\/themen\/04678\/04711\/04777\/index.html?lang=de<\/li>\n<li>www.ils.uzh.ch\/Diagnostik\/NENT.html<\/li>\n<li>Spina A, et al : Spectrum of enteropathogens detected by the FilmArray GI Panel in a multicenter study of community-acquired gastroenteritis. Clin Microbiol Infect 2015 ; 21 : 719.<\/li>\n<li>Kotloff KL, et al. : Burden and aetiology of diarrheeal disease in infants and young children in developing countries (the Global Enteric Multicenter Study, GEMS) : a prospective, case-control study. Lancet 2013 ; 382 : 209.<\/li>\n<li>Allerberger F : Diarrh\u00e9e aigu\u00eb : nouvelles perspectives. Clin Microbiol Infect 2015 ; 21 : 717.<\/li>\n<\/ol>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><em>PRATIQUE DU M\u00c9DECIN DE FAMILLE 2016, 11(12) : 40-45<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>La diarrh\u00e9e est d\u00e9finie par l&#8217;\u00e9mission d&#8217;au moins trois selles non form\u00e9es en l&#8217;espace de 24 heures. 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