{"id":381275,"date":"2024-06-08T23:00:00","date_gmt":"2024-06-08T21:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/medizinonline.com\/une-methode-danalyse-innovante-permet-de-nouvelles-decouvertes-sur-le-microbiome-cutane\/"},"modified":"2024-08-09T10:16:25","modified_gmt":"2024-08-09T08:16:25","slug":"une-methode-danalyse-innovante-permet-de-nouvelles-decouvertes-sur-le-microbiome-cutane","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/une-methode-danalyse-innovante-permet-de-nouvelles-decouvertes-sur-le-microbiome-cutane\/","title":{"rendered":"Une m\u00e9thode d’analyse innovante permet de nouvelles d\u00e9couvertes sur le microbiome cutan\u00e9"},"content":{"rendered":"\n

Les liens entre la dysbiose cutan\u00e9e et les maladies de la peau font l’objet de recherches intensives depuis quelques ann\u00e9es. Une \u00e9quipe de recherche impliquant l’Universit\u00e9 technique de Munich a r\u00e9cemment r\u00e9ussi \u00e0 obtenir de nouvelles informations sur le r\u00f4le de la dysbiose cutan\u00e9e dans la maladie de Darier gr\u00e2ce \u00e0 l’analyse du transcriptome et \u00e0 d\u00e9couvrir des associations avec des caract\u00e9ristiques de la maladie telles que les processus inflammatoires et les odeurs. Le barcoding de l’ADN a \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9 en combinaison avec une technologie de s\u00e9quen\u00e7age moderne.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

La maladie de Darier (encadr\u00e9)<\/strong> est souvent associ\u00e9e \u00e0 des infections cutan\u00e9es bact\u00e9riennes et virales [1]. Dodiuk-Gad et al. ont d\u00e9montr\u00e9 une forte pr\u00e9valence de colonisation par Staphylococcus aureus (S.aureus)<\/em>dans les l\u00e9sions cutan\u00e9es chez les patients atteints de la maladie de Darier [4]. En outre, une corr\u00e9lation a \u00e9t\u00e9 \u00e9tablie entre la gravit\u00e9 de la maladie et l’\u00e9tendue de la colonisation par S. aureus<\/em>. Ces r\u00e9sultats indiquent un r\u00f4le pathog\u00e8ne du microbiome. Cependant, jusqu’\u00e0 r\u00e9cemment, aucune \u00e9tude n’avait analys\u00e9 le microbiome cutan\u00e9 de patients atteints de la maladie de Darier \u00e0 l’aide de m\u00e9thodes de s\u00e9quen\u00e7age de nouvelle g\u00e9n\u00e9ration.<\/p>\n\n

La maladie de Darier (M. Darier) est une maladie de la peau \u00e0 transmission autosomique dominante, caract\u00e9ris\u00e9e par des anomalies de l’adh\u00e9sion cellule-cellule des k\u00e9ratinocytes et par une k\u00e9ratinisation anormale de la peau qui en r\u00e9sulte [1]. La cause est une mutation du g\u00e8ne ATPA2 qui entra\u00eene une perturbation de la signalisation intracellulaire du Ca2+. Les manifestations cliniques sont des papules dysk\u00e9ratosiques, g\u00e9n\u00e9ralement dans les zones s\u00e9borrh\u00e9iques et intertrigineuses. Il y a souvent une atteinte palmoplantaire et une atteinte des ongles [2,3].<\/td><\/tr><\/tbody><\/table><\/figure>\n\n

Analyse microbiologique par l’approche du m\u00e9tabarcoding 16S<\/h3>\n\n

Afin de d\u00e9terminer le r\u00f4le des microbes dans l’inflammation de la peau et l’odeur d\u00e9sagr\u00e9able caract\u00e9ristique de la M. Darier, le Dr Yacine Amar et ses coll\u00e8gues ont men\u00e9 une \u00e9tude en utilisant le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e8ne de l’ARNr 16S [5,6]. Ils ont pu montrer que le microbiome sp\u00e9cifique \u00e0 la maladie dans la M. Darier se caract\u00e9rise par une perte de diversit\u00e9 microbienne et de micro-organismes potentiellement utiles. En outre, les microbes associ\u00e9s \u00e0 l’inflammation \u00e9taient fortement corr\u00e9l\u00e9s \u00e0 la s\u00e9v\u00e9rit\u00e9 de la maladie et \u00e0 l’odeur corporelle. L’\u00e9tude d’Amar et al. Les patients atteints de la maladie de Darier (n=14) et les t\u00e9moins sains appari\u00e9s pour l’\u00e2ge et le sexe (n=14) ont \u00e9t\u00e9 inclus dans l’\u00e9tude [5]. Au total, 115 frottis ont \u00e9t\u00e9 pr\u00e9lev\u00e9s et analys\u00e9s par une approche de m\u00e9tabarcoding 16S. Il s’agit de combiner le barcoding traditionnel de l’ADN avec le s\u00e9quen\u00e7age de nouvelle g\u00e9n\u00e9ration. Les \u00e9couvillons cutan\u00e9s des patients atteints de la maladie de Darier ont \u00e9t\u00e9 pr\u00e9lev\u00e9s sur des zones inguinales et axillaires enflamm\u00e9es (IDS) et non enflamm\u00e9es (NIDS). Au total, il y avait 3,27 \u00d7106<\/sup> lectures filtr\u00e9es avec un nombre moyen de lectures de haute qualit\u00e9 de 2,84 \u00d7104<\/sup> par \u00e9chantillon, ce qui a donn\u00e9 348 unit\u00e9s taxonomiques op\u00e9rationnelles ( <\/em>OTU) diff\u00e9rentes dans les \u00e9chantillons analys\u00e9s [6]. <\/p>\n\n

Microbiome cutan\u00e9 sp\u00e9cifique \u00e0 une maladie identifi\u00e9 <\/h3>\n\n

Dans le cas de la maladie de Darier, tous les pr\u00e9l\u00e8vements cutan\u00e9s (IDS et NIDS) \u00e9taient caract\u00e9ris\u00e9s par une colonisation accrue de staphylocoques, accompagn\u00e9e d’une r\u00e9duction de la proportion de cutibact\u00e9ries. Les analyses au niveau des esp\u00e8ces (97% de similitude des OTU) ont montr\u00e9 une abondance relative \u00e9lev\u00e9e de lectures associ\u00e9es \u00e0 S. aureus<\/em> et S. warneri<\/em> dans les pr\u00e9l\u00e8vements cutan\u00e9s des patients, ainsi qu’une diminution simultan\u00e9e des commensaux potentiellement utiles tels que S. epidermidis, S. hominis, Cutibacterium acnes, Streptococcus thermophilus, Paracoccus yeei<\/em> et Micrococcus luteus<\/em> [6]. La dysbiose associ\u00e9e \u00e0 la M. Darier \u00e9tait caract\u00e9ris\u00e9e par une augmentation des esp\u00e8ces appartenant aux groupes des coryn\u00e9bact\u00e9ries, des staphylocoques et des streptocoques, qui \u00e9taient fortement corr\u00e9l\u00e9es \u00e0 l’intensit\u00e9 de l’odeur [5]. Les analyses transcriptomiques ont r\u00e9v\u00e9l\u00e9 une r\u00e9gulation \u00e9lev\u00e9e des voies de r\u00e9paration \u00e9pidermique, d’inflammation et de d\u00e9fense immunitaire, refl\u00e9tant les m\u00e9canismes \u00e9pith\u00e9liaux et immunologiques de la dysbiose associ\u00e9e \u00e0 la maladie de Darier. En revanche, la r\u00e9gulation n\u00e9gative de la cadh\u00e9rine-4 et de la claudine-4, prot\u00e9ine de la jonction \u00e9tanche, indique une alt\u00e9ration de la barri\u00e8re cutan\u00e9e [5,6]. Dans l’ensemble, ces r\u00e9sultats d’analyse soulignent le r\u00f4le de la dysbiose cutan\u00e9e dans l’inflammation de la maladie de Darier et la formation d’odeurs associ\u00e9es, et sugg\u00e8rent \u00e9galement des biomarqueurs potentiels [5,6]. <\/p>\n\n

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