{"id":386533,"date":"2024-10-23T14:00:00","date_gmt":"2024-10-23T12:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/medizinonline.com\/nouvelles-connaissances-grace-a-la-multiomique-et-au-systeme-de-reporting-biotechnologique\/"},"modified":"2024-10-23T14:39:06","modified_gmt":"2024-10-23T12:39:06","slug":"nouvelles-connaissances-grace-a-la-multiomique-et-au-systeme-de-reporting-biotechnologique","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/nouvelles-connaissances-grace-a-la-multiomique-et-au-systeme-de-reporting-biotechnologique\/","title":{"rendered":"Nouvelles connaissances gr\u00e2ce \u00e0 la multiomique et au syst\u00e8me de reporting biotechnologique"},"content":{"rendered":"\n

Les m\u00e9tabolites pr\u00e9sents dans les \u00e9chantillons de s\u00e9rum, d’urine et de selles permettent d’identifier les patients atteints de cirrhose aigu\u00eb d\u00e9compens\u00e9e qui pr\u00e9sentent une “insuffisance h\u00e9patique aigu\u00eb sur chronique”, ce qui permet de prendre des mesures diagnostiques et th\u00e9rapeutiques pr\u00e9coces.\nTelle est la conclusion d’un projet d’\u00e9tude r\u00e9cent.\nDans un projet men\u00e9 par une autre \u00e9quipe de recherche, le syst\u00e8me de reporting “EXSISERS” a permis d’obtenir des informations int\u00e9ressantes sur la pertinence du statut p53 dans la p\u00e9ritonite bact\u00e9rienne spontan\u00e9e, une complication infectieuse associ\u00e9e \u00e0 la cirrhose du foie. <\/strong><\/p>\n\n\n\n

La fibrose ou la cirrhose h\u00e9patique avanc\u00e9e sont regroup\u00e9es sous le terme de “maladie h\u00e9patique chronique avanc\u00e9e” (ACLD).\nLa maladie h\u00e9patique chronique avanc\u00e9e se caract\u00e9rise par des l\u00e9sions persistantes et une cicatrisation progressive du foie.\nLe stade final de la fibrose h\u00e9patique est la cirrhose du foie.\nLes patients atteints de cirrhose avec d\u00e9compensation aigu\u00eb (AD) ont un risque accru de d\u00e9velopper une “insuffisance h\u00e9patique aigu\u00eb sur chronique” (ACLF).\nL’ACLF se caract\u00e9rise par une d\u00e9faillance d’organe extra-h\u00e9patique et une inflammation syst\u00e9mique.\nL’ACLF est associ\u00e9e \u00e0 un risque grave de complications infectieuses et \u00e0 une mortalit\u00e9 \u00e9lev\u00e9e \u00e0 court terme.\nAfin d’am\u00e9liorer le pronostic des patients concern\u00e9s, des mesures diagnostiques et th\u00e9rapeutiques pr\u00e9coces sont n\u00e9cessaires en cas d’ACLF [1].\nDechaumet et al.\nont pr\u00e9sent\u00e9, lors du congr\u00e8s de l’EASL de cette ann\u00e9e, un projet de recherche dans lequel des signatures m\u00e9tabolomiques ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9es pour distinguer les patients atteints de MA avec ou sans ACLF.\nVoici un r\u00e9sum\u00e9 de ce projet de recherche et d’un autre sur les maladies h\u00e9patiques avanc\u00e9es [2,3]. <\/p>\n\n

Analyse des donn\u00e9es de la cohorte MUCOSA-PREDICT <\/h3>\n\n

L’ensemble des substances de faible poids mol\u00e9culaire (m\u00e9tabolites) est appel\u00e9 m\u00e9tabolome.\nLa mesure du m\u00e9tabolome peut \u00eatre effectu\u00e9e, par exemple, par chromatographie, spectrom\u00e9trie de masse ou spectroscopie de r\u00e9sonance magn\u00e9tique nucl\u00e9aire.\nLe foie est un organe m\u00e9taboliquement tr\u00e8s actif et les maladies h\u00e9patiques sont de plus en plus \u00e9tudi\u00e9es en utilisant \u00e9galement des m\u00e9thodes multiomiques (Fig. 1)<\/strong> [10].\nMoreau et al.\nont rapport\u00e9 en 2020 dans le Journal of Hepatology qu’ils avaient pu identifier dans des \u00e9chantillons de tissus, \u00e0 l’aide d’une approche multiomique, une empreinte digitale sp\u00e9cifique de l’ACLF compos\u00e9e de 38 m\u00e9tabolites dans le sang, qui est corr\u00e9l\u00e9e \u00e0 l’inflammation syst\u00e9mique et qui fonctionne comme indicateur d’un dysfonctionnement mitochondrial dans les organes p\u00e9riph\u00e9riques [4]. <\/p>\n

\n
\"\"<\/a><\/figure>\n<\/div>\n

Objectifs et m\u00e9thodologie de l’\u00e9tude : <\/strong>Le projet de Dechaumet et al.\nvisait \u00e0 ,\n(i) d’examiner si l’\u00e9tude des m\u00e9tabolites dans les \u00e9chantillons d’urine et de selles pr\u00e9sente une valeur ajout\u00e9e pour la caract\u00e9risation du m\u00e9tabolome chez les patients atteints de cirrhose d\u00e9compens\u00e9e et\n(ii) d’\u00e9valuer comment la m\u00e9tabolomique multi-matrice peut contribuer \u00e0 am\u00e9liorer la stratification des patients atteints de cirrhose d\u00e9compens\u00e9e [2].\nPour ce faire, les chercheurs ont analys\u00e9 des \u00e9chantillons de s\u00e9rum, d’urine et de selles de la cohorte MUCOSA-PREDICT, dans laquelle 93 patients atteints de cirrhose avec d\u00e9compensation aigu\u00eb sont suivis, en utilisant la chromatographie liquide coupl\u00e9e \u00e0 la spectrom\u00e9trie de masse \u00e0 haute r\u00e9solution.\nAu total, 402 m\u00e9tabolites ont \u00e9t\u00e9 d\u00e9tect\u00e9s et identifi\u00e9s dans les trois matrices biologiques. <\/p>\n\n

R\u00e9sultats : <\/strong>Le plus grand nombre de m\u00e9tabolites dont les concentrations sont influenc\u00e9es par l’ACLF a \u00e9t\u00e9 observ\u00e9 dans des \u00e9chantillons de s\u00e9rum [2].\nIl est int\u00e9ressant de noter que les concentrations de certains m\u00e9tabolites dans l’urine et les selles, qui n’ont pas \u00e9t\u00e9 d\u00e9tect\u00e9es dans le s\u00e9rum, ont \u00e9galement \u00e9t\u00e9 influenc\u00e9es par l’ACLF.\nCependant, les analyses de courbes ROC effectu\u00e9es pour les signatures m\u00e9tabolomiques dans des matrices individuelles ou combin\u00e9es ont montr\u00e9 que la signature s\u00e9rique \u00e9tait la plus performante pour distinguer la MA de l’ACLF.\nIl s’agit d’une constatation cliniquement pertinente, car les deux pathologies se chevauchent dans certains cas, mais il s’agit d’entit\u00e9s diff\u00e9rentes en termes de physiopathologie et de traitement. <\/p>\n\n

Mise en \u0153uvre du syst\u00e8me de reporting “EXSISERS<\/h3>\n\n

L’axe intestin-foie d\u00e9crit les multiples interactions entre l’intestin et le foie, y compris les \u00e9changes de composants cellulaires et mol\u00e9culaires, et joue un r\u00f4le central dans la r\u00e9gulation de processus (patho)physiologiques essentiels.\nLes patients atteints de cirrhose du foie pr\u00e9sentent une \u00e9paisseur de muqueuse r\u00e9duite, ce qui facilite le contact direct des bact\u00e9ries avec les cellules \u00e9pith\u00e9liales et la d\u00e9gradation des compos\u00e9s cellulaires [5].\nLa translocation bact\u00e9rienne est consid\u00e9r\u00e9e comme une \u00e9tape cruciale dans la pathogen\u00e8se des infections bact\u00e9riennes [6].\nPar exemple, la translocation de bact\u00e9ries intestinales dans les ganglions lymphatiques m\u00e9sent\u00e9riques est un \u00e9v\u00e9nement central dans la p\u00e9ritonite bact\u00e9rienne spontan\u00e9e.\nLa p\u00e9ritonite bact\u00e9rienne spontan\u00e9e** est une inflammation du liquide d’ascite qui est particuli\u00e8rement fr\u00e9quente en cas de cirrhose du foie et qui peut avoir de graves cons\u00e9quences. <\/p>\n\n

** Les bact\u00e9ries les plus fr\u00e9quentes \u00e0 l’origine des p\u00e9ritonites bact\u00e9riennes spontan\u00e9es sont Escherichia coli et Klebsiella pneumoniae \u00e0 Gram n\u00e9gatif et Streptococcus pneumoniae \u00e0 Gram positif [11].<\/em><\/p>\n\n

Objectifs et m\u00e9thodologie de l’\u00e9tude : <\/strong>Selon Ernst et al.\nle stress cellulaire provoqu\u00e9 par le contact direct avec les bact\u00e9ries affecte la famille de facteurs de transcription p53, qui agit comme un r\u00e9gulateur crucial du cycle cellulaire, des m\u00e9canismes de r\u00e9paration et de la mort cellulaire (apoptose) [3].\nDans sa forme sauvage, p53 (wtp53) agit comme un suppresseur de tumeur central [7].\nLa famille des facteurs de transcription p53 comprend les prot\u00e9ines p63 et p73, qui sont structurellement et fonctionnellement homologues.\nDans un grand nombre de tumeurs, on observe une alt\u00e9ration de la fonction de p53 (mutations TP53).\nDans leur \u00e9tude, Ernst et al.\nles effets des bact\u00e9ries de l’ascite sur l’expression des isoformes$<\/sup> de p53 en ce qui concerne l’induction de la mort cellulaire dans les cellules \u00e9pith\u00e9liales.\nPour ce faire, ils ont utilis\u00e9 un nouveau syst\u00e8me de reporting biotechnologique [3].\nLe syst\u00e8me de reporting appel\u00e9 EXSISERS peut suivre l’expression des isoformes sur une longue p\u00e9riode dans des cellules vivantes [8]. <\/p>\n\n

$<\/sup> Les isoformes sont des variantes de prot\u00e9ines issues d’un seul g\u00e8ne.<\/em><\/p>\n\n

Trois syst\u00e8mes rapporteurs d’inteines lucif\u00e9rases sp\u00e9cifiques d’exons (EXSISERS) ont \u00e9t\u00e9 int\u00e9gr\u00e9s aux exons 2, 4 et 7 du g\u00e8ne TP53.\nLes prot\u00e9ines cliv\u00e9es permettent le clivage de l’enzyme lucif\u00e9rase du polypeptide p53, tout en pr\u00e9servant l’int\u00e9grit\u00e9 structurelle des isoformes p53 [9].\nCette m\u00e9thode permet de quantifier avec pr\u00e9cision les rapports des isoformes de la prot\u00e9ine p53 au niveau cellulaire.\nDes cellules HCT116-EXISERS ont \u00e9t\u00e9 mises en culture avec des Escherichia coli <\/em>provenant de patients et les trois principaux groupes d’isoformes p53 – p53 pleine longueur induisant l’arr\u00eat du cycle cellulaire, \u039440p53 induisant la mort cellulaire, \u0394133p53\/\u0394160p53 pro-prolif\u00e9rative – ont \u00e9t\u00e9 mesur\u00e9s.\nParall\u00e8lement, la mort cellulaire induite par les bact\u00e9ries a \u00e9t\u00e9 quantifi\u00e9e dans les cellules HCT116 p53 de type sauvage et p53 knock-out.\nLa microscopie \u00e9lectronique a \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9e pour d\u00e9terminer le type de mort cellulaire. <\/p>\n\n

R\u00e9sultats : <\/strong>La co-culture de bact\u00e9ries provenant de patients avec des cellules HCT116-EXISERS a d’abord entra\u00een\u00e9, en 15 minutes, une augmentation de la production de l’isoforme p53 \u039440p53 qui d\u00e9clenche la mort cellulaire [3].\nEnsuite, il y a eu une diminution des isoformes p53 pro-prolif\u00e9ratives \u0394133p53\/\u0394160p53.\nParall\u00e8lement, en r\u00e9ponse au contact avec les bact\u00e9ries, une apoptose a \u00e9t\u00e9 observ\u00e9e, qui pr\u00e9sentait des caract\u00e9ristiques morphologiques de paraptose, y compris un gonflement mitochondrial et une vacuolisation cytoplasmique.\nParall\u00e8lement aux changements morphologiques observ\u00e9s, la cytom\u00e9trie de flux a confirm\u00e9 des dommages aux mitochondries et \u00e0 la membrane plasmique.\nL’acinomycine D, un inhibiteur de paraptose bien connu, a bloqu\u00e9 efficacement la mort cellulaire induite par les bact\u00e9ries.\nEn accord avec l’induction mesur\u00e9e de l’isoforme \u039440p53, l’induction de la mort cellulaire a \u00e9t\u00e9 consid\u00e9rablement retard\u00e9e par un knock-out de p53 m\u00e9di\u00e9 par CRISPR\/Cas9. <\/p>\n\n

R\u00e9sum\u00e9<\/strong><\/td><\/tr>
En cas de cirrhose du foie avec d\u00e9compensation aigu\u00eb (AD), le risque de d\u00e9velopper une “acute-on-chronic liver failure” (ACLF) est plus \u00e9lev\u00e9.\nDans l’\u00e9tude de Dechaumet et al.\na d\u00e9montr\u00e9 que les signatures m\u00e9taboliques du sang, mais aussi de l’urine et des f\u00e8ces, diff\u00e9rencient les patients atteints de MA de ceux qui ne le sont pas.\nLes donn\u00e9es obtenues \u00e0 partir du compartiment sanguin semblent fournir les meilleures performances de stratification. <\/td><\/tr>
Chez les patients atteints de cirrhose du foie, une translocation bact\u00e9rienne se produit en raison d’une int\u00e9grit\u00e9 \u00e9pith\u00e9liale alt\u00e9r\u00e9e.\nLes r\u00e9ponses cellulaires au stress provoqu\u00e9 par les bact\u00e9ries sont r\u00e9gul\u00e9es par des isoformes sp\u00e9cifiques de p53.\nL’\u00e9tude de Ernst et al.\nmontre que le statut de p53 a une influence d\u00e9cisive sur la sensibilit\u00e9 \u00e0 la paraptose.\nL’induction ou la stabilisation cibl\u00e9e de certaines isoformes de p53 pourrait donc constituer une option th\u00e9rapeutique pour le traitement de la p\u00e9ritonite bact\u00e9rienne spontan\u00e9e. <\/td><\/tr>
vers [2,3]<\/em><\/td><\/tr><\/tbody><\/table><\/figure>\n\n

Congr\u00e8s : EASL Congress 2024<\/em><\/p>\n\n

Litt\u00e9rature :<\/p>\n\n

    \n
  1. H\u00fcbener P, Braun G, Fuhrmann V : Med Klin Intensivmed Notfmed 2018 ; 113(8) : 649-657.<\/li>\n\n\n\n
  2. Dechaumet S, et al : Multi-compart metabolomics for stratifying cirrhotic patients with acute decompensation, WED-083, EASL Congress, Milan, 5-8 June 2024.<\/li>\n\n\n\n
  3. Ernst M, et al : Liver cirrhosis and epithelial damage – The gut-liver axis in spontaneous bacterial peritonitis and its modulation by p53, WED-106, EASL Congress, Milan, 5-8 June 2024.<\/li>\n\n\n\n
  4. Moreau R, et al : J Hepatol 2020 ; 72 : 688-701.<\/li>\n\n\n\n
  5. Haderer, M. et al : Gut 2022 ; 71 : 580-592. <\/li>\n\n\n\n
  6. Rayes N : \u00c9tude exp\u00e9rimentale et clinique de l’influence des pr\u00e9- et probiotiques sur la translocation bact\u00e9rienne et les infections postop\u00e9ratoires apr\u00e8s une intervention chirurgicale abdominale, th\u00e8se d’habilitation, 2004, https:\/\/core.ac.uk,<\/a>(derni\u00e8re consultation 27.08.2024) <\/li>\n\n\n\n
  7. Weilbacher A : Die Rolle des p53-Status f\u00fcr die Sensitivit\u00e4t von Tumoren gegen\u00fcber unterschiedlichen p53 Aktivatoren, th\u00e8se de doctorat, 2017, https:\/\/elib.uni-stuttgart.de,<\/a>(derni\u00e8re consultation 27.08.2024).<\/li>\n\n\n\n
  8. “De nouvelles prot\u00e9ines de conception rendent les isoformes visibles de mani\u00e8re non invasive”, Helmholtz Munich, 04.06.2021. <\/li>\n\n\n\n
  9. Truong, D-JJ, et al : Interrogation non invasive et \u00e0 haut d\u00e9bit de l’expression d’isoformes sp\u00e9cifiques d’exon. Nature Cell Biology 2021, doi:10.1038\/s41556-021-00678-x<\/li>\n\n\n\n
  10. Raja G, et al.: Recent Advances of Microbiome-Associated Metabolomics Profiling in Liver Disease: Principles, Mechanisms, and Applications. International Journal of Molecular Sciences 2021; 22(3): 1160. www.mdpi.com\/1422-0067\/22\/3\/1160#<\/a>, (letzter Abruf 27.08.2024)\u00a0<\/li>\n\n\n\n
  11. “P\u00e9ritonite bact\u00e9rienne spontan\u00e9e (PBS)”, Danielle Tholey, MD, www.msdmanuals.com\/de,<\/a>(derni\u00e8re consultation 27.08.2024).<\/li>\n<\/ol>\n\n

    <\/p>\n\n

    HAUSARZT PRAXIS 2024 ; 19(9) : 38-39 (publi\u00e9 le 18.9.24, ahead of print)<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

    Les m\u00e9tabolites pr\u00e9sents dans les \u00e9chantillons de s\u00e9rum, d’urine et de selles permettent d’identifier les patients atteints de cirrhose aigu\u00eb d\u00e9compens\u00e9e qui pr\u00e9sentent une “insuffisance h\u00e9patique aigu\u00eb sur chronique”, ce…<\/p>\n","protected":false},"author":7,"featured_media":386537,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"pmpro_default_level":"","cat_1_feature_home_top":false,"cat_2_editor_pick":false,"csco_eyebrow_text":"Cirrhose du foie ","footnotes":""},"category":[11549,11527,11535],"tags":[15556,78632,78629,78568,78631,78630,78569,78628,78627],"powerkit_post_featured":[],"class_list":["post-386533","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","category-rx-fr","category-etudes","category-rapports-de-congres","tag-cirrhose-du-foie","tag-congres-de-leasl-2024","tag-exsisers-fr","tag-exsisers","tag-insuffisance-hepatique-aigue-sur-chronique","tag-multiomics-fr","tag-multiomics","tag-statut-de-p53","tag-systeme-de-reporting-biotechnologique","pmpro-has-access"],"acf":[],"publishpress_future_action":{"enabled":false,"date":"2026-07-14 07:48:21","action":"change-status","newStatus":"draft","terms":[],"taxonomy":"category","extraData":[]},"publishpress_future_workflow_manual_trigger":{"enabledWorkflows":[]},"wpml_current_locale":"fr_FR","wpml_translations":{"it_IT":{"locale":"it_IT","id":386527,"slug":"nuove-intuizioni-attraverso-la-multiomica-e-il-sistema-di-reporter-biotecnologico","post_title":"Nuove intuizioni attraverso la multiomica e il sistema di reporter biotecnologico","href":"https:\/\/medizinonline.com\/it\/nuove-intuizioni-attraverso-la-multiomica-e-il-sistema-di-reporter-biotecnologico\/"},"pt_PT":{"locale":"pt_PT","id":386521,"slug":"novos-conhecimentos-atraves-da-multi-omica-e-do-sistema-reporter-biotecnologico","post_title":"Novos conhecimentos atrav\u00e9s da multi-\u00f3mica e do sistema rep\u00f3rter biotecnol\u00f3gico","href":"https:\/\/medizinonline.com\/pt-pt\/novos-conhecimentos-atraves-da-multi-omica-e-do-sistema-reporter-biotecnologico\/"},"es_ES":{"locale":"es_ES","id":386514,"slug":"nuevos-conocimientos-a-traves-de-la-multiomica-y-el-sistema-reportero-biotecnologico","post_title":"Nuevos conocimientos a trav\u00e9s de la multi\u00f3mica y el sistema reportero biotecnol\u00f3gico","href":"https:\/\/medizinonline.com\/es\/nuevos-conocimientos-a-traves-de-la-multiomica-y-el-sistema-reportero-biotecnologico\/"}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/386533","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/7"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=386533"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/386533\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":388734,"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/386533\/revisions\/388734"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/386537"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=386533"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/category?post=386533"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=386533"},{"taxonomy":"powerkit_post_featured","embeddable":true,"href":"https:\/\/medizinonline.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/powerkit_post_featured?post=386533"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}