La diagnosi precoce del cancro al seno offre ancora le migliori possibilità di cura. La mammografia è il punto di riferimento per lo screening, ma è soggetta a limitazioni tecniche, logistiche e diagnostiche. Per questo motivo, la ricerca si sta svolgendo a pieno ritmo su diverse procedure di test per poter individuare la malattia il più precocemente possibile.
Un esame del sangue efficace e accurato per rilevare gli stadi iniziali della malattia dovrebbe aumentare il tasso di diagnosi precoce del cancro al seno. Pertanto, sono stati condotti una serie di studi sui lipidi in pazienti con cancro al seno precoce e i set di dati sono stati combinati utilizzando un’analisi basata sull’apprendimento automatico per verificare se questi profili possono rilevare il cancro al seno nel plasma [1]. I campioni di sangue sono stati raccolti da donne con cancro al seno di stadio 0-IV (4 coorti separate) e da controlli senza cancro al seno corrispondenti per età e BMI. I lipidi delle vescicole extracellulari arricchite di plasma sono stati estratti e analizzati mediante LC-MS di massa ad alta risoluzione e precisione. È stato utilizzato un software disponibile in commercio per annotare e quantificare >400 specie lipidiche curate manualmente. Dopo la selezione delle variabili, è stata identificata una firma lipidica per distinguere i campioni di cancro al seno da quelli di controllo. I campioni di plasma delle donne con cancro al seno sono stati discriminati dai controlli con un’accuratezza media cross-validata di 0,81 e un’AUC media di 0,84 in 4 coorti. Un sottoinsieme ottimizzato di coorti incrociate di IDC, DCIS e ILC in fase precoce è stato discriminato dai controlli con un’AUC cross-validata di 0,90, una sensibilità di 0,88 e una specificità di 0,82 (201 tumori al seno in fase precoce, 199 controlli). Per questa coorte ottimizzata, il nostro test ha raggiunto una sensibilità di 0,71 con una specificità prescritta di 0,90 e una sensibilità di 0,89 con una specificità prescritta di 0,80, rispettivamente. Di conseguenza, lo studio è stato in grado di mostrare un’elevata sensibilità e specificità di una firma di biomarcatori lipidici con un potenziale per la diagnosi precoce del cancro al seno.
Quando l’uso di bifosfonati è indicato
L’amplificazione del gene del fattore di trascrizione MAF è stata associata a un aumento delle metastasi ossee nel cancro al seno. Inoltre, si potrebbe dimostrare che le pazienti senza amplificazione MAF nel tumore primario hanno maggiori probabilità di beneficiare dei bifosfonati adiuvanti. Una firma genomica potrebbe identificare i pazienti che non presentano un’amplificazione MAF come candidati ai bifosfonati adiuvanti. Pertanto, sono stati studiati i geni che potrebbero predire lo stato di amplificazione MAF [2]. Poiché l’amplificazione MAF è associata a un rischio elevato di metastasi ossee, per stratificare i gruppi di pazienti sono state utilizzate una firma di 70 geni per il rischio di recidiva a distanza (MammaPrint/MP) e una firma di 80 geni per la sottotipizzazione molecolare (BluePrint/BP). Un totale di 166 pazienti con BC sono stati inclusi in questa coorte pilota. L’ibridazione in situ a fluorescenza è stata eseguita per rilevare il numero di copie MAF. Un rapporto segnale-core (SNR) di ≥2,5 è stato utilizzato come soglia per la MAF-amplificata (MAF+). L’analisi dell’espressione genica differenziale è stata eseguita con R limma utilizzando i dati del microarray dell’intero genoma. MAF+ e MAF- (SNR<2,5) sono stati confrontati in tutti i pazienti e nei pazienti abbinati per MP/BP per bilanciare i gruppi ad alto rischio. I geni espressi in modo differenziale (DEG) sono stati definiti come variazione assoluta delle pieghe ≥2 e valore p aggiustato <0.05. La previsione dell’amplificazione MAF basata sull’espressione genica è stata eseguita utilizzando una metrica basata sulla correlazione con un set di addestramento e 1179 pazienti BC di stadio I-III dello studio FLEX (NCT03053193), che include saggi MP/BP e dati completi del trascrittoma.
Dei 166 pazienti, il 12% era MAF+ e l’88% MAF-. Dei pazienti MAF+, il 95% erano pazienti ad alto rischio MP, come previsto dall’associazione tra amplificazione MAF e metastasi ossee, rispetto al 29% dei pazienti MAF-. È notevole che non ci sia stata una correlazione significativa tra l’amplificazione e l’espressione del gene MAF, sottolineando l’importanza di usare altri geni per prevedere l’amplificazione MAF. Confrontando l’intero trascrittoma dei pazienti MAF+ e MAF-, sono stati trovati 48 DEG. Dai confronti MP/BP, i geni con un cambiamento ≥2 volte sono stati inclusi nel gruppo finale di 57 geni, con un arricchimento dei geni che codificano i ligandi delle chemochine a motivo C-X-C e la proteina legante il calcio S100. Il classificatore a 57 geni per lo stato MAF ha raggiunto un’accuratezza del 92%, una specificità del 94% e una sensibilità del 75% nel gruppo di formazione. È interessante notare che quando il classificatore è stato applicato alla coorte FLEX, è stato identificato il 12% di casi MAF+, simile al gruppo di formazione.
Congresso: Riunione annuale ASCO
Letteratura:
- Kehelpannala C, Pascovici D, Li D, et al: Individuazione del cancro al seno in fase iniziale nelle donne mediante la profilazione lipidomica del plasma. J Clin Oncol 40, 2022 (suppl. 16; abstr 554).
- Nasrazadani A, Gomez Marti JL, Hyder T, et al: Studio di una firma genomica per l’amplificazione del gene MAF del fattore di trascrizione e la mancanza di benefici del bifosfonato nel cancro al seno precoce. J Clin Oncol 40, 2022 (suppl 16; abstr 559).
InFo ONCOLOGIA & EMATOLOGIA 2022; 10(3): 20 (pubblicato il 20.6.22, prima della stampa).
