L’évolution des conditions environnementales, comme le réchauffement climatique, joue un rôle dans la genèse de nouvelles infections, jusqu’ici largement inconnues. Grâce aux diagnostics microbiologiques de routine et spécialisés les plus modernes, tels que la spectroscopie de masse MALDI-TOF, même les espèces pathogènes rares et inhabituelles peuvent être identifiées comme base d’un traitement ciblé efficace.
Le professeur Ojan Assadian, directeur médical de la clinique régionale de Wiener Neustadt (A), a présenté une casuistique d’infections de plaies peu communes dans le cadre de la réunion annuelle de l’Austrian Wound Association (AWA) [1]. Les méthodes de diagnostic microbiologique ont été considérablement améliorées ces dernières années grâce au développement de techniques de différenciation génétique moléculaire. Cependant, la détection directe basée sur la PCR ne permet pas de répondre à toutes les questions de diagnostic, de sorte que d’autres technologies sont nécessaires.
Temps de vol de désorption/ionisation laser assisté par matrice (MALDI-TOF)
L’identification des agents pathogènes par spectroscopie de masse à temps de vol par désorption laser/ionisation assistée par matrice fait partie des réalisations les plus modernes. “A partir de 2010 environ, la méthode MALDI-TOF a pénétré le domaine de la microbiologie de routine et est désormais utilisée par presque tous les laboratoires”, a déclaré le conférencier. Ceci est en corrélation avec une augmentation soudaine des rapports d’infections par des espèces pathogènes inhabituelles. Le professeur Assadian a utilisé plusieurs études de cas pour démontrer les avantages cliniques de la méthode MALDI-TOF, qui se caractérise par une grande précision, des temps d’analyse courts et une faisabilité économique.
Yersinia ruckeria – les dangers bactériens guettent dans la rivière…
Lors d’une sortie en canoë, un jeune homme de 16 ans a subi une profonde coupure-écorchure au niveau de la jambe gauche après avoir heurté une pierre. Le lendemain, il a remarqué une cellulite importante au niveau de la zone de la blessure. A l’hôpital, une gaze imbibée d’iode PVP a été appliquée sur la plaie et le patient a également reçu de l’amoxicilline/acide clavulanique par voie i.v. [4]. L’analyse préalable de la culture bactérienne par spectroscopie de masse MALDI-TOF a permis de détecter Yersinia ruckeria (log score : 1,969) et Yersinia pestis (log score : 1,887). Y. pestis est l’agent pathogène de la peste, une maladie à déclaration obligatoire. Par la suite, le patient a été immédiatement isolé et enfermé. L’échantillon a ensuite été envoyé à un laboratoire de référence, où un séquençage a été effectué, confirmant avec 100% de certitude que l’agent pathogène était bien le Y. ruckeri n’a pas été utilisée. “Une méthode conventionnelle aurait probablement révélé une quelconque entérobactérie”, a fait remarquer le conférencier. Le troisième jour après le début du traitement, le patient a pu quitter l’hôpital et une guérison complète est intervenue le vingtième jour. “Y. ruckeri a été décrite pour la première fois comme l’agent de la maladie entérique du rouget chez la truite, il s’agit donc d’une zoonose, mais il semble qu’elle puisse également entraîner une infection des plaies chez l’homme”, explique le professeur Assadian [1].
… et aussi dans la mer : Vibrio alginolyticus
Un autre cas d’infection de plaie liée aux sports nautiques est celui d’un homme de 51 ans qui a été mordu à la main par une pieuvre fraîchement pêchée en Méditerranée. Malgré un traitement topique avec une pommade contenant de la bacitracine et de la néomycine, la morsure n’a pas guéri et une rougeur et un gonflement massifs se sont développés. Le diagnostic microbiologique a permis de détecter la présence de Vibrio alginolyticus. “Il s’agit d’un agent pathogène que l’on trouve dans la mer et qui peut provoquer une infection des plaies”, explique le conférencier. Le patient a été traité avec de la ciprofloxacine et la plaie a guéri sans complications au bout de deux semaines [5].
Plaie qui ne guérit pas – Un travail de détective qui en vaut la peine
Dans le cas d’un homme de 70 ans, il s’est également avéré, après un long diagnostic de détective, qu’il s’agissait d’une infection à V. alginolyticus. Suite à une blessure à vélo, une plaie chronique s’est développée au niveau de la jambe droite. Il s’agissait par ailleurs d’un patient en bonne santé et sportif (non-fumeur, pas de diabète ni d’hypertension). Lors d’un séjour au bord de la Méditerranée, il a été contaminé par de l’eau de mer. Le traitement initial par le médecin généraliste consistait en un nettoyage de la plaie, des pansements et de l’iode PVP, mais n’a pas permis d’améliorer la situation au bout de deux mois. Un diagnostic microbiologique a donc été effectué. Parallèlement, d’autres causes possibles de la plaie chronique non cicatrisée ont été explorées, sans résultats anormaux (indice Doppler = 1, pas d’ostéomyélite). L’analyse microbiologique a permis de détecter la présence de V. alginolyticus. Le traitement a consisté en un débridement de la plaie et en un traitement par lévofloxacine : d’abord 2× 500 mg pendant 7 jours, puis 1× 750 mg pendant 13 jours. Après 1 mois, une guérison complète a été constatée.
Depuis 2010 environ, les rapports de cas d’infections à V. alginolyticus sont en augmentation dans le monde entier. Cela est en corrélation avec le réchauffement global de la planète, explique le conférencier, qui ajoute : “Avec le réchauffement des océans, nous sommes entrés dans une fourchette où ces espèces de vibrions sont plus fréquentes”.
Congrès : Austrian Wound Association
Littérature :
- Assadian O : Des temps nouveaux : Infections de plaies curieuses. Ojan Assadian, Association autrichienne des plaies, 25.03.2022
- Schubert S, Weig M : Procédés basés sur le MALDI-TOF-MS pour la différenciation des bactéries et des champignons. Dans : Neumeister B, al. : Bactériologie. Diagnostic microbiologique, 2009. Partie II Méthodes d’analyse microbiologique : 8 Procédés manuels et automatisés.
- Claydon MA, et al : Nature Biotechnol 1996 ; 14 : 1584-1586.
- De Keukeleire S, et al : New Microbes New Infect 2014 ; 2(4) : 134-135.
- Campanelli A, Sanchez-Politta S, Saurat JH : Ann Dermatol Venereol 2008 ; 135(3) : 225-227.
- Wieser A, et al : Appl Microbiol Biotechnol 2012 : 93(3) : 965-974.
DERMATOLOGIE PRATIQUE 2022 ; 32(3) : 43
