La recherche sur le microbiome cutané a pris de plus en plus d’importance ces dernières années. Une étude présentée lors de la réunion annuelle de l’ADF 2019 a examiné les effets des corticoïdes externes locaux sur la composition du microbiote cutané des personnes atopiques. Des résultats intéressants ont été obtenus.
Dans les maladies de la peau telles que la dermatite atopique, une diversité réduite du microbiome cutané est mesurable par rapport à une peau saine [1,2,5,6]. Dans les phases aiguës de l’eczéma atopique, on observe une augmentation de la colonisation de Staphylococcus aureus (S. aureus) sur les zones cutanées touchées et un déplacement d’autres espèces bactériennes. La dysbiose microbienne des lésions cutanées atopiques enflammées a fait l’objet de nombreuses études. Cependant, les résultats concernant les interactions hôte-microbiome sont encore peu nombreux.
La colonisation de S. aureus varie
Dans cette étude, des échantillons de peau lésionnelle et non lésionnelle des plis du coude de patients atopiques (n=7) ont été analysés par biologie moléculaire avant et après un traitement par une préparation topique à base de cortisone (Dermatop®) [7] et comparés aux biopsies d’un groupe de contrôle à la peau saine (n=8). [1,2] (Fig. 1). Un séquençage de l’amplicon 16S a été utilisé avec un appareil Illumina MiSeq TM [3], ainsi que “Rhea”, un ensemble de scripts R pour l’analyse des profils microbiens [4].
A la ligne de base, le microbiome cutané des biopsies à l’état lésionnel contenait une plus grande proportion de S. aureus qu’à l’état non lésionnel (35,7% contre 20,59%). En comparaison, la colonisation de S. aureusdans les échantillons de peau non atopique était nettement plus faible (<5%). Les différences de diversité des commensaux, qui sont nettement plus élevées dans les biopsies non atopiques, sont également très marquées. Après 1 semaine de traitement avec un Dermatop® [7], une réduction de la colonisation par S. aureus a été mesurée à la fois dans le microbiome de la peau lésionnelle et dans celui des zones de peau non lésionnelle (à 18,60% et 7,91% respectivement). Après 2 semaines de traitement, la proportion de S. aureus a augmenté de manière significative dans les échantillons de microbiome lésionnel et non lésionnel, pour atteindre des valeurs similaires à celles de la ligne de base (32,10% et 20,90% respectivement).
Il y a beaucoup de recherches à faire
L’effet des différents traitements sur le microbiome cutané de la dermatite atopique est l’une des nombreuses questions qui restent à résoudre. Par exemple, à l’heure actuelle, on ne sait pas exactement si les changements microbiens dans la dermatite atopique (par exemple, une augmentation de la colonisation par S. aureus) sont la cause ou la conséquence du dysfonctionnement de la barrière épidermique et des processus inflammatoires [6]. Les stratégies de traitement futures sont non seulement le développement des thérapies actuelles, mais aussi de nouvelles approches telles que la manipulation du microbiome par l’application topique de commensaux [5]. En tout cas, le suspense reste entier.
Source : ADF, Munich-Garching (D)
Littérature :
- Amar Y, et al : Diversité du microbiome cutané et profilage du transcriptome chez les patients atteints de dermatite atopique. 46th Annual Meeting of the Arbeitsgemeinschaft Dermatologische Forschung (ADF). P015. Experimental Dermatology 2019 ; 28(3) : e1-e122 https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/exd.13859
- Amar Y, et al : Exploration of Microbiome Shifts in Dermatop treated atopic dermatitis patients. Poster presentation, ADF Annual Meeting, München-Garching, March 16 2019.
- Système MiSeqTM, www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/datasheets/miseq-data-sheet-770-2011-001-translations/
- miseq-specification-sheet-770-2011-001-deu.pdf
- Lagkouvardos I, et al : Rhea : un pipeline R transparent et modulaire pour le profilage microbien basé sur des amplicons de gènes d’ARNr 16S. Peer J 2017 ; 5:e2836.
- Paller, et al : Le microbiome chez les patients atteints de dermatite atopique. Journal of Allergy and Clinical Immunology 2019 ; 143 (1) ; 26-35.
- Kim JE, Kim HS : Microbiome de la peau et des biens dans la dermatite atopique (DA) : comprendre la pathophysiologie et trouver de nouvelles stratégies de gestion. Clin Med 2019 ; 8(4). pii : E444. doi : 10.3390/jcm8040444. Dermatop : Information professionnelle. https://info.diagnosia.com/de-de/p/377917/dermatop
DERMATOLOGIE PRATIQUE 2019 ; 29(4) : 22
