Les énormes progrès réalisés ces dernières années dans le domaine de la génétique humaine ont déjà permis d’identifier la cause de plus de quatre mille maladies (congénitales) d’origine génétique. Ainsi, il est aujourd’hui possible d’établir, de confirmer ou d’exclure un diagnostic chez un nombre croissant de personnes au moyen d’une analyse génétique du patrimoine génétique (test génétique, à ne pas confondre avec les tests génétiques sur Internet).
Le test génétique peut être effectué en pré- ou post-natal par l’étude des chromosomes (cytogénétique) et/ou des gènes (génétique moléculaire). Il est principalement utilisé dans les situations où les examens cliniques habituels ne permettent pas de tirer des conclusions définitives. Ceci est particulièrement important dans les premières phases d’une maladie ainsi que chez les enfants et les adolescents.
Raccourcir le calvaire
La caractérisation génétique précoce et claire de la maladie a non seulement une influence positive sur le pronostic et la gestion de la maladie, mais elle raccourcit aussi massivement le calvaire diagnostique des personnes concernées, qui dure souvent des années. Même si un diagnostic clinique semble sûr, les tests génétiques peuvent être indispensables. Par exemple, dans le cas de maladies dont la mutation causale peut être présente dans différents gènes. Cette situation s’applique par exemple au syndrome de Marfan (MFS), une maladie rare du tissu conjonctif, car des mutations dans plusieurs gènes sont en cause lors de la suspicion clinique de MFS.
Une maladie est considérée comme rare si elle touche au maximum une personne sur 2000. Il existe plus de 5000 maladies rares. Au total, environ un demi-million de Suisses en souffrent, soit autant que de diabète. Comme 80% des maladies rares sont d’origine génétique, l’analyse génétique revêt une importance capitale dans ce contexte.
Thérapie, prévention et planning familial
Même si la plupart des maladies génétiques ne sont pas encore guérissables aujourd’hui, la connaissance du défaut génétique sous-jacent est la base d’une gestion ciblée de la maladie. Les stratégies thérapeutiques peuvent être adaptées à chaque mutation : La recherche est toujours à la recherche de nouveaux médicaments sur mesure qui tiennent compte des caractéristiques génétiques individuelles des patients, ce qui caractérise la médecine personnalisée.
En outre, les tests génétiques présymptomatiques avant la manifestation de la maladie permettent une prévention ciblée et, si la mutation familiale est connue, les examens génétiques sont également particulièrement importants dans le cadre de la planification familiale.
Quelles sont les options disponibles ?
La principale méthode d’analyse génétique ciblée est le séquençage de l’ADN, qui détermine les bases nucléotidiques du patrimoine génétique et permet ainsi de détecter avec précision les mutations génétiques. C’est déjà une réalité que les analyses génétiques soient effectuées par séquençage à haut débit (“next generation sequencing”, NGS), qui permet de séquencer soit une combinaison sélectionnée de gènes (appelée panel), soit le génome entier (“whole genome”, 3 milliards de bases) ou sa région codante (“whole exome”, ~20 000 gènes) en un temps relativement court et à moindre coût par rapport au séquençage classique.
Cependant, la qualité, le stockage et l’analyse bioinformatique ainsi que l’interprétation des énormes données générées par le NGS représentent toujours un défi important et coûteux, même si la liste actuelle des analyses avec la nouvelle position pour le NGS peut donner une impression différente.
L’expertise est essentielle
C’est précisément l’interprétation des données NGS avec une certitude diagnostique qui exige une grande expertise et peut être énormément laborieuse. C’est pourquoi cette évaluation doit être confiée à des spécialistes en génétique médicale FAMH/FMH. En outre, un NGS de plus de dix gènes ne peut être prescrit que par des médecins titulaires d’un titre fédéral de formation postgraduée en “génétique médicale”. De même, le conseil génétique requis par la loi avant et après une analyse génétique devrait être fourni par des généticiens médicaux.
PRATIQUE DU MÉDECIN DE FAMILLE 2015 ; 10(3) : 4
