A tiroidite auto-imune do tipo Hashimoto progride insidiosamente na maioria dos doentes e a longo prazo leva à destruição da glândula tiróide com a consequência do hipotiroidismo. No entanto, há também fases com hipertiroidismo passivo (hashitoxicosis). A doença pode ocorrer em qualquer idade, mas é mais comum na idade adulta média e mais velha. As mulheres são afectadas com muito mais frequência do que os homens. O tratamento com hormonas da tiróide permite às pessoas afectadas levarem uma vida normal.