Die Diagnose einer Borrelieninfektion gestaltet sich nicht immer als einfach. Es gibt Fälle, in welchen ein vorliegendes Beschwerdebild zunächst nicht mit einem Zeckenstich in Verbindung gebracht wird oder atypisch ist. Eine serologische Abklärung ist im Frühstadium der Borreliose nicht indiziert, kann aber in späteren Stadien sehr aufschlussreich sein. IgM-Antikörper sind hinweisend auf eine akute Borreliose und im späteren Verlauf werden IgG-Antikörper gebildet, die lebenslang nachweisbar sein können.
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